Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Astn1Q61137 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Astn1Q61137 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Astn1Q61137 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Astn1Q61137 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Astn1Q61137 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Astn1Q61137 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Astn1Q61137 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Astn1Q61137 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Astn1Q61137 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Astn1Q61137 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Astn1Q61137 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Astn1Q61137 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Astn1Q61137 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Astn1Q61137 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Astn1Q61137 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Astn1Q61137 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Astn1Q61137 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Astn1Q61137 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Astn1Q61137 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Astn1Q61137 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Astn1Q61137 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Astn1Q61137 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Astn1Q61137 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Astn1Q61137 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Astn1Q61137 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Astn1Q61137 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Astn1Q61137 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Astn1Q61137 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Astn1Q61137 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Astn1Q61137 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Astn1Q61137 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Astn1Q61137 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Astn1Q61137 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Astn1Q61137 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Astn1Q61137 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Astn1Q61137 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Astn1Q61137 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Astn1Q61137 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Astn1Q61137 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Astn1Q61137 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Astn1Q61137 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Astn1Q61137 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Astn1Q61137 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Astn1Q61137 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Astn1Q61137 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Astn1Q61137 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Astn1Q61137 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Astn1Q61137 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Astn1Q61137 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Astn1Q61137 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Astn1Q61137 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Astn1Q61137 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Astn1Q61137 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Astn1Q61137 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Astn1Q61137 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Astn1Q61137 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Astn1Q61137 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Astn1Q61137 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Astn1Q61137 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Astn1Q61137 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Astn1Q61137 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Astn1Q61137 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Astn1Q61137 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Astn1Q61137 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms