Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Satb1Q60611 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Satb1Q60611 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Satb1Q60611 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Satb1Q60611 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Satb1Q60611 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Satb1Q60611 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Satb1Q60611 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Satb1Q60611 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Satb1Q60611 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Satb1Q60611 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Satb1Q60611 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Satb1Q60611 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Satb1Q60611 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Satb1Q60611 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Satb1Q60611 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Satb1Q60611 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Satb1Q60611 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Satb1Q60611 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Satb1Q60611 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Satb1Q60611 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Satb1Q60611 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Satb1Q60611 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Satb1Q60611 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Satb1Q60611 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Satb1Q60611 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Satb1Q60611 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Satb1Q60611 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Satb1Q60611 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Satb1Q60611 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Satb1Q60611 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Satb1Q60611 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Satb1Q60611 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Satb1Q60611 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Satb1Q60611 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Satb1Q60611 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Satb1Q60611 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Satb1Q60611 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Satb1Q60611 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Satb1Q60611 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Satb1Q60611 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Satb1Q60611 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Satb1Q60611 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Satb1Q60611 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Satb1Q60611 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Satb1Q60611 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Satb1Q60611 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Satb1Q60611 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Satb1Q60611 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms