Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PfasQ5SUR0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PfasQ5SUR0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PfasQ5SUR0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PfasQ5SUR0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PfasQ5SUR0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PfasQ5SUR0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PfasQ5SUR0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PfasQ5SUR0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PfasQ5SUR0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PfasQ5SUR0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PfasQ5SUR0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PfasQ5SUR0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PfasQ5SUR0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PfasQ5SUR0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PfasQ5SUR0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PfasQ5SUR0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PfasQ5SUR0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PfasQ5SUR0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PfasQ5SUR0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PfasQ5SUR0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PfasQ5SUR0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PfasQ5SUR0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PfasQ5SUR0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PfasQ5SUR0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PfasQ5SUR0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PfasQ5SUR0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PfasQ5SUR0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PfasQ5SUR0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PfasQ5SUR0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PfasQ5SUR0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PfasQ5SUR0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PfasQ5SUR0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PfasQ5SUR0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PfasQ5SUR0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PfasQ5SUR0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PfasQ5SUR0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms