Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU28

Pcnx2, Pecanex-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcnx2Q5DU28 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Pcnx2Q5DU28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcnx2Q5DU28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pcnx2Q5DU28 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcnx2Q5DU28 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcnx2Q5DU28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcnx2Q5DU28 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcnx2Q5DU28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcnx2Q5DU28 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcnx2Q5DU28 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcnx2Q5DU28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcnx2Q5DU28 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcnx2Q5DU28 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcnx2Q5DU28 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcnx2Q5DU28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Pcnx2Q5DU28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcnx2Q5DU28 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Pcnx2Q5DU28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcnx2Q5DU28 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcnx2Q5DU28 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcnx2Q5DU28 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Pcnx2Q5DU28 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcnx2Q5DU28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcnx2Q5DU28 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Pcnx2Q5DU28 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcnx2Q5DU28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcnx2Q5DU28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcnx2Q5DU28 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcnx2Q5DU28 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcnx2Q5DU28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcnx2Q5DU28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcnx2Q5DU28 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcnx2Q5DU28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcnx2Q5DU28 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcnx2Q5DU28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms