Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36,17■■■■□ 3,38
Kdm5aQ3UXZ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,16■■■■□ 3,38
Kdm5aQ3UXZ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36,16■■■■□ 3,38
Kdm5aQ3UXZ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Kdm5aQ3UXZ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Kdm5aQ3UXZ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Kdm5aQ3UXZ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,14■■■■□ 3,38
Kdm5aQ3UXZ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Kdm5aQ3UXZ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36,13■■■■□ 3,37
Kdm5aQ3UXZ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Kdm5aQ3UXZ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Kdm5aQ3UXZ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Kdm5aQ3UXZ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Kdm5aQ3UXZ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Kdm5aQ3UXZ9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36,07■■■■□ 3,37
Kdm5aQ3UXZ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
Kdm5aQ3UXZ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Kdm5aQ3UXZ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Kdm5aQ3UXZ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36,01■■■■□ 3,36
Kdm5aQ3UXZ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35,99■■■■□ 3,35
Kdm5aQ3UXZ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Kdm5aQ3UXZ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Kdm5aQ3UXZ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Kdm5aQ3UXZ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Kdm5aQ3UXZ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Kdm5aQ3UXZ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Kdm5aQ3UXZ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Kdm5aQ3UXZ9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35,91■■■■□ 3,34
Kdm5aQ3UXZ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Kdm5aQ3UXZ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Kdm5aQ3UXZ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35,87■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35,85■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35,82■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35,82■■■■□ 3,33
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Kdm5aQ3UXZ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Kdm5aQ3UXZ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Kdm5aQ3UXZ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Kdm5aQ3UXZ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Kdm5aQ3UXZ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Kdm5aQ3UXZ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Kdm5aQ3UXZ9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35,74■■■■□ 3,31
Kdm5aQ3UXZ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Kdm5aQ3UXZ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Kdm5aQ3UXZ9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Kdm5aQ3UXZ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Kdm5aQ3UXZ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Kdm5aQ3UXZ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35,7■■■■□ 3,31
Kdm5aQ3UXZ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35,68■■■■□ 3,3
Kdm5aQ3UXZ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Kdm5aQ3UXZ9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Kdm5aQ3UXZ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Kdm5aQ3UXZ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Kdm5aQ3UXZ9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Kdm5aQ3UXZ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Kdm5aQ3UXZ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Kdm5aQ3UXZ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35,57■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,52■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35,52■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Kdm5aQ3UXZ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Kdm5aQ3UXZ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35,49■■■■□ 3,27
Kdm5aQ3UXZ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Kdm5aQ3UXZ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Kdm5aQ3UXZ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6,8 ms