Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2fbQ3UWQ3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2fbQ3UWQ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2fbQ3UWQ3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2fbQ3UWQ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2fbQ3UWQ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2fbQ3UWQ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2fbQ3UWQ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2fbQ3UWQ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2fbQ3UWQ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2fbQ3UWQ3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ube2fbQ3UWQ3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ube2fbQ3UWQ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2fbQ3UWQ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube2fbQ3UWQ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms