Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtl4Q3URY0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtl4Q3URY0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rtl4Q3URY0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtl4Q3URY0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtl4Q3URY0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtl4Q3URY0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtl4Q3URY0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtl4Q3URY0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtl4Q3URY0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtl4Q3URY0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtl4Q3URY0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtl4Q3URY0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtl4Q3URY0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtl4Q3URY0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtl4Q3URY0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtl4Q3URY0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rtl4Q3URY0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms