Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
VwceQ3U515 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
VwceQ3U515 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
VwceQ3U515 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
VwceQ3U515 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
VwceQ3U515 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
VwceQ3U515 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,84■■□□□ 1,41
VwceQ3U515 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23,83■■□□□ 1,41
VwceQ3U515 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23,82■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,81■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23,79■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23,78■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
VwceQ3U515 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23,74■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,73■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
VwceQ3U515 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
VwceQ3U515 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
VwceQ3U515 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
VwceQ3U515 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
VwceQ3U515 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
VwceQ3U515 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
VwceQ3U515 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23,66■■□□□ 1,38
VwceQ3U515 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
VwceQ3U515 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
VwceQ3U515 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,64■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23,62■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
VwceQ3U515 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
VwceQ3U515 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
VwceQ3U515 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23,57■■□□□ 1,36
VwceQ3U515 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23,57■■□□□ 1,36
VwceQ3U515 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
VwceQ3U515 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
VwceQ3U515 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23,53■■□□□ 1,36
VwceQ3U515 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23,52■■□□□ 1,36
VwceQ3U515 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
VwceQ3U515 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23,5■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
VwceQ3U515 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
VwceQ3U515 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
VwceQ3U515 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
VwceQ3U515 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
VwceQ3U515 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
VwceQ3U515 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23,41■■□□□ 1,34
VwceQ3U515 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
VwceQ3U515 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
VwceQ3U515 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
VwceQ3U515 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,37■■□□□ 1,33
VwceQ3U515 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms