Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Trpm1Q2TV84 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Trpm1Q2TV84 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Trpm1Q2TV84 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Trpm1Q2TV84 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Trpm1Q2TV84 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Trpm1Q2TV84 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Trpm1Q2TV84 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Trpm1Q2TV84 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Trpm1Q2TV84 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Trpm1Q2TV84 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Trpm1Q2TV84 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Trpm1Q2TV84 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Trpm1Q2TV84 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Trpm1Q2TV84 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Trpm1Q2TV84 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Trpm1Q2TV84 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Trpm1Q2TV84 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Trpm1Q2TV84 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Trpm1Q2TV84 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Trpm1Q2TV84 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Trpm1Q2TV84 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Trpm1Q2TV84 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Trpm1Q2TV84 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Trpm1Q2TV84 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Trpm1Q2TV84 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Trpm1Q2TV84 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Trpm1Q2TV84 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Trpm1Q2TV84 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Trpm1Q2TV84 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Trpm1Q2TV84 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Trpm1Q2TV84 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Trpm1Q2TV84 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Trpm1Q2TV84 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Trpm1Q2TV84 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Trpm1Q2TV84 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Trpm1Q2TV84 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Trpm1Q2TV84 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Trpm1Q2TV84 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Trpm1Q2TV84 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Trpm1Q2TV84 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Trpm1Q2TV84 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trpm1Q2TV84 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trpm1Q2TV84 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trpm1Q2TV84 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Trpm1Q2TV84 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Trpm1Q2TV84 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Trpm1Q2TV84 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Trpm1Q2TV84 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Trpm1Q2TV84 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Trpm1Q2TV84 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Trpm1Q2TV84 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Trpm1Q2TV84 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Trpm1Q2TV84 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Trpm1Q2TV84 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Trpm1Q2TV84 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Trpm1Q2TV84 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Trpm1Q2TV84 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Trpm1Q2TV84 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Trpm1Q2TV84 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Trpm1Q2TV84 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Trpm1Q2TV84 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Trpm1Q2TV84 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Trpm1Q2TV84 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Trpm1Q2TV84 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Trpm1Q2TV84 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Trpm1Q2TV84 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Trpm1Q2TV84 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Trpm1Q2TV84 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Trpm1Q2TV84 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Trpm1Q2TV84 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Trpm1Q2TV84 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Trpm1Q2TV84 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Trpm1Q2TV84 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Trpm1Q2TV84 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Trpm1Q2TV84 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Trpm1Q2TV84 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Trpm1Q2TV84 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Trpm1Q2TV84 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Trpm1Q2TV84 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Trpm1Q2TV84 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Trpm1Q2TV84 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Trpm1Q2TV84 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Trpm1Q2TV84 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms