Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rpusd2Q149F1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rpusd2Q149F1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rpusd2Q149F1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rpusd2Q149F1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rpusd2Q149F1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpusd2Q149F1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpusd2Q149F1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpusd2Q149F1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rpusd2Q149F1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpusd2Q149F1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rpusd2Q149F1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rpusd2Q149F1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpusd2Q149F1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpusd2Q149F1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpusd2Q149F1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpusd2Q149F1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpusd2Q149F1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rpusd2Q149F1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rpusd2Q149F1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rpusd2Q149F1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rpusd2Q149F1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rpusd2Q149F1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rpusd2Q149F1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rpusd2Q149F1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rpusd2Q149F1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rpusd2Q149F1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rpusd2Q149F1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpusd2Q149F1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpusd2Q149F1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpusd2Q149F1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpusd2Q149F1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpusd2Q149F1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpusd2Q149F1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpusd2Q149F1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpusd2Q149F1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpusd2Q149F1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpusd2Q149F1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpusd2Q149F1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpusd2Q149F1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpusd2Q149F1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpusd2Q149F1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpusd2Q149F1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpusd2Q149F1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpusd2Q149F1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpusd2Q149F1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpusd2Q149F1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpusd2Q149F1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpusd2Q149F1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpusd2Q149F1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpusd2Q149F1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpusd2Q149F1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpusd2Q149F1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpusd2Q149F1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rpusd2Q149F1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rpusd2Q149F1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rpusd2Q149F1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rpusd2Q149F1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rpusd2Q149F1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rpusd2Q149F1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rpusd2Q149F1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rpusd2Q149F1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rpusd2Q149F1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rpusd2Q149F1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rpusd2Q149F1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rpusd2Q149F1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rpusd2Q149F1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rpusd2Q149F1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Rpusd2Q149F1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpusd2Q149F1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpusd2Q149F1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpusd2Q149F1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rpusd2Q149F1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rpusd2Q149F1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rpusd2Q149F1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rpusd2Q149F1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rpusd2Q149F1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rpusd2Q149F1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rpusd2Q149F1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rpusd2Q149F1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rpusd2Q149F1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rpusd2Q149F1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpusd2Q149F1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpusd2Q149F1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rpusd2Q149F1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpusd2Q149F1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
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