Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb8Q0VBD0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb8Q0VBD0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb8Q0VBD0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb8Q0VBD0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb8Q0VBD0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb8Q0VBD0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb8Q0VBD0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb8Q0VBD0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb8Q0VBD0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb8Q0VBD0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb8Q0VBD0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms