Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Neurl1bQ0MW30 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Neurl1bQ0MW30 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Neurl1bQ0MW30 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Neurl1bQ0MW30 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurl1bQ0MW30 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurl1bQ0MW30 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurl1bQ0MW30 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurl1bQ0MW30 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurl1bQ0MW30 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl1bQ0MW30 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl1bQ0MW30 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Neurl1bQ0MW30 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Neurl1bQ0MW30 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Neurl1bQ0MW30 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl1bQ0MW30 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Neurl1bQ0MW30 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurl1bQ0MW30 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Neurl1bQ0MW30 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurl1bQ0MW30 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurl1bQ0MW30 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl1bQ0MW30 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurl1bQ0MW30 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurl1bQ0MW30 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurl1bQ0MW30 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Neurl1bQ0MW30 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Neurl1bQ0MW30 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurl1bQ0MW30 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurl1bQ0MW30 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurl1bQ0MW30 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurl1bQ0MW30 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurl1bQ0MW30 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurl1bQ0MW30 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurl1bQ0MW30 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurl1bQ0MW30 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurl1bQ0MW30 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Neurl1bQ0MW30 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurl1bQ0MW30 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurl1bQ0MW30 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurl1bQ0MW30 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurl1bQ0MW30 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurl1bQ0MW30 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurl1bQ0MW30 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurl1bQ0MW30 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Neurl1bQ0MW30 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Neurl1bQ0MW30 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Neurl1bQ0MW30 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Neurl1bQ0MW30 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Neurl1bQ0MW30 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Neurl1bQ0MW30 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurl1bQ0MW30 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurl1bQ0MW30 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurl1bQ0MW30 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms