Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PtprgQ05909 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PtprgQ05909 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
PtprgQ05909 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtprgQ05909 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtprgQ05909 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PtprgQ05909 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PtprgQ05909 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PtprgQ05909 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PtprgQ05909 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PtprgQ05909 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PtprgQ05909 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PtprgQ05909 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PtprgQ05909 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PtprgQ05909 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PtprgQ05909 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprgQ05909 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprgQ05909 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprgQ05909 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PtprgQ05909 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprgQ05909 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprgQ05909 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PtprgQ05909 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PtprgQ05909 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
PtprgQ05909 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PtprgQ05909 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
PtprgQ05909 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
PtprgQ05909 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprgQ05909 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PtprgQ05909 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PtprgQ05909 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PtprgQ05909 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PtprgQ05909 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PtprgQ05909 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PtprgQ05909 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PtprgQ05909 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PtprgQ05909 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PtprgQ05909 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PtprgQ05909 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PtprgQ05909 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PtprgQ05909 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PtprgQ05909 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PtprgQ05909 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PtprgQ05909 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PtprgQ05909 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprgQ05909 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprgQ05909 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprgQ05909 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PtprgQ05909 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PtprgQ05909 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PtprgQ05909 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PtprgQ05909 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PtprgQ05909 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PtprgQ05909 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprgQ05909 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PtprgQ05909 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PtprgQ05909 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PtprgQ05909 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PtprgQ05909 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PtprgQ05909 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PtprgQ05909 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
PtprgQ05909 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PtprgQ05909 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PtprgQ05909 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PtprgQ05909 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PtprgQ05909 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PtprgQ05909 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtprgQ05909 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PtprgQ05909 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PtprgQ05909 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PtprgQ05909 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PtprgQ05909 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PtprgQ05909 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PtprgQ05909 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PtprgQ05909 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PtprgQ05909 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PtprgQ05909 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PtprgQ05909 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PtprgQ05909 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PtprgQ05909 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PtprgQ05909 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PtprgQ05909 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
PtprgQ05909 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PtprgQ05909 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PtprgQ05909 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PtprgQ05909 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PtprgQ05909 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PtprgQ05909 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms