Protein–RNA interactions for Protein: P97454

Smad5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad5P97454 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad5P97454 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad5P97454 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smad5P97454 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad5P97454 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad5P97454 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad5P97454 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad5P97454 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad5P97454 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad5P97454 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad5P97454 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad5P97454 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad5P97454 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad5P97454 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad5P97454 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad5P97454 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad5P97454 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad5P97454 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad5P97454 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad5P97454 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad5P97454 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad5P97454 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad5P97454 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad5P97454 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad5P97454 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad5P97454 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad5P97454 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad5P97454 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad5P97454 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad5P97454 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad5P97454 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad5P97454 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad5P97454 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad5P97454 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad5P97454 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms