Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Surf6P70279 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Surf6P70279 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Surf6P70279 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Surf6P70279 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Surf6P70279 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Surf6P70279 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Surf6P70279 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Surf6P70279 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Surf6P70279 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Surf6P70279 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Surf6P70279 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Surf6P70279 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Surf6P70279 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Surf6P70279 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Surf6P70279 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Surf6P70279 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Surf6P70279 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Surf6P70279 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Surf6P70279 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Surf6P70279 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Surf6P70279 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Surf6P70279 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Surf6P70279 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Surf6P70279 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Surf6P70279 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Surf6P70279 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Surf6P70279 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Surf6P70279 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Surf6P70279 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Surf6P70279 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Surf6P70279 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Surf6P70279 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Surf6P70279 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Surf6P70279 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Surf6P70279 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Surf6P70279 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Surf6P70279 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Surf6P70279 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Surf6P70279 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Surf6P70279 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf6P70279 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Surf6P70279 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Surf6P70279 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Surf6P70279 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Surf6P70279 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Surf6P70279 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Surf6P70279 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Surf6P70279 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Surf6P70279 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Surf6P70279 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Surf6P70279 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Surf6P70279 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Surf6P70279 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms