Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr3bP59470 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr3bP59470 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr3bP59470 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr3bP59470 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr3bP59470 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr3bP59470 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr3bP59470 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr3bP59470 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr3bP59470 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr3bP59470 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr3bP59470 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr3bP59470 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr3bP59470 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3bP59470 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3bP59470 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3bP59470 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3bP59470 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3bP59470 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3bP59470 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3bP59470 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3bP59470 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr3bP59470 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr3bP59470 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Polr3bP59470 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Polr3bP59470 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Polr3bP59470 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr3bP59470 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr3bP59470 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr3bP59470 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr3bP59470 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr3bP59470 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr3bP59470 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr3bP59470 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Polr3bP59470 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr3bP59470 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms