Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdf1P59326 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdf1P59326 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdf1P59326 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdf1P59326 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ythdf1P59326 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ythdf1P59326 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ythdf1P59326 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ythdf1P59326 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdf1P59326 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ythdf1P59326 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ythdf1P59326 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdf1P59326 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdf1P59326 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdf1P59326 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdf1P59326 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdf1P59326 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdf1P59326 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdf1P59326 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdf1P59326 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdf1P59326 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdf1P59326 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdf1P59326 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms