Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Csrnp1P59054 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Csrnp1P59054 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Csrnp1P59054 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Csrnp1P59054 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Csrnp1P59054 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Csrnp1P59054 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Csrnp1P59054 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Csrnp1P59054 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Csrnp1P59054 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Csrnp1P59054 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Csrnp1P59054 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Csrnp1P59054 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Csrnp1P59054 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Csrnp1P59054 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Csrnp1P59054 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Csrnp1P59054 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Csrnp1P59054 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Csrnp1P59054 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Csrnp1P59054 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Csrnp1P59054 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Csrnp1P59054 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Csrnp1P59054 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Csrnp1P59054 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Csrnp1P59054 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Csrnp1P59054 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Csrnp1P59054 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Csrnp1P59054 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Csrnp1P59054 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Csrnp1P59054 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Csrnp1P59054 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Csrnp1P59054 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Csrnp1P59054 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Csrnp1P59054 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Csrnp1P59054 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Csrnp1P59054 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Csrnp1P59054 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Csrnp1P59054 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Csrnp1P59054 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Csrnp1P59054 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Csrnp1P59054 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Csrnp1P59054 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Csrnp1P59054 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Csrnp1P59054 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Csrnp1P59054 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Csrnp1P59054 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Csrnp1P59054 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Csrnp1P59054 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Csrnp1P59054 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Csrnp1P59054 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Csrnp1P59054 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Csrnp1P59054 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Csrnp1P59054 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Csrnp1P59054 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Csrnp1P59054 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Csrnp1P59054 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Csrnp1P59054 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Csrnp1P59054 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Csrnp1P59054 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Csrnp1P59054 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Csrnp1P59054 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Csrnp1P59054 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Csrnp1P59054 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Csrnp1P59054 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Csrnp1P59054 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Csrnp1P59054 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Csrnp1P59054 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Csrnp1P59054 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Csrnp1P59054 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Csrnp1P59054 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Csrnp1P59054 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Csrnp1P59054 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Csrnp1P59054 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Csrnp1P59054 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Csrnp1P59054 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Csrnp1P59054 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Csrnp1P59054 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms