Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NcanP55066 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NcanP55066 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NcanP55066 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NcanP55066 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NcanP55066 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NcanP55066 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NcanP55066 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NcanP55066 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NcanP55066 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NcanP55066 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NcanP55066 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NcanP55066 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NcanP55066 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NcanP55066 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NcanP55066 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NcanP55066 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NcanP55066 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NcanP55066 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NcanP55066 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NcanP55066 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NcanP55066 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NcanP55066 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NcanP55066 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NcanP55066 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NcanP55066 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NcanP55066 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NcanP55066 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NcanP55066 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NcanP55066 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NcanP55066 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NcanP55066 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NcanP55066 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NcanP55066 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NcanP55066 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NcanP55066 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NcanP55066 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NcanP55066 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NcanP55066 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NcanP55066 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NcanP55066 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NcanP55066 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NcanP55066 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NcanP55066 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NcanP55066 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NcanP55066 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NcanP55066 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NcanP55066 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NcanP55066 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NcanP55066 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NcanP55066 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NcanP55066 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NcanP55066 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NcanP55066 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NcanP55066 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NcanP55066 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NcanP55066 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NcanP55066 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NcanP55066 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NcanP55066 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NcanP55066 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NcanP55066 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NcanP55066 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NcanP55066 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NcanP55066 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NcanP55066 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NcanP55066 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NcanP55066 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NcanP55066 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NcanP55066 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NcanP55066 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NcanP55066 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NcanP55066 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NcanP55066 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NcanP55066 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NcanP55066 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NcanP55066 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NcanP55066 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NcanP55066 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NcanP55066 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NcanP55066 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NcanP55066 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NcanP55066 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NcanP55066 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NcanP55066 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NcanP55066 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NcanP55066 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NcanP55066 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NcanP55066 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NcanP55066 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NcanP55066 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NcanP55066 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NcanP55066 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NcanP55066 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NcanP55066 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NcanP55066 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NcanP55066 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NcanP55066 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NcanP55066 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NcanP55066 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms