Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klf1P46099 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klf1P46099 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klf1P46099 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klf1P46099 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klf1P46099 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Klf1P46099 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klf1P46099 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klf1P46099 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klf1P46099 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klf1P46099 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klf1P46099 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Klf1P46099 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Klf1P46099 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klf1P46099 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klf1P46099 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klf1P46099 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klf1P46099 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klf1P46099 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klf1P46099 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klf1P46099 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klf1P46099 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klf1P46099 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klf1P46099 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klf1P46099 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klf1P46099 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf1P46099 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf1P46099 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klf1P46099 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klf1P46099 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klf1P46099 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klf1P46099 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms