Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad52P43352 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad52P43352 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad52P43352 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad52P43352 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad52P43352 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad52P43352 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad52P43352 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad52P43352 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad52P43352 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad52P43352 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad52P43352 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad52P43352 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad52P43352 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad52P43352 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad52P43352 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad52P43352 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad52P43352 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad52P43352 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rad52P43352 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad52P43352 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad52P43352 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad52P43352 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms