Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pola1P33609 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pola1P33609 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pola1P33609 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pola1P33609 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pola1P33609 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pola1P33609 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pola1P33609 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pola1P33609 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Pola1P33609 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Pola1P33609 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Pola1P33609 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pola1P33609 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Pola1P33609 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pola1P33609 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pola1P33609 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Pola1P33609 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Pola1P33609 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Pola1P33609 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pola1P33609 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pola1P33609 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pola1P33609 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pola1P33609 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pola1P33609 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Pola1P33609 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Pola1P33609 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Pola1P33609 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pola1P33609 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pola1P33609 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Pola1P33609 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pola1P33609 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pola1P33609 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pola1P33609 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pola1P33609 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pola1P33609 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pola1P33609 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pola1P33609 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pola1P33609 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pola1P33609 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Pola1P33609 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pola1P33609 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pola1P33609 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pola1P33609 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pola1P33609 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pola1P33609 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pola1P33609 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Pola1P33609 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pola1P33609 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pola1P33609 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pola1P33609 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pola1P33609 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pola1P33609 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Pola1P33609 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pola1P33609 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pola1P33609 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pola1P33609 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pola1P33609 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pola1P33609 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Pola1P33609 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pola1P33609 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pola1P33609 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pola1P33609 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pola1P33609 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pola1P33609 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Pola1P33609 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pola1P33609 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pola1P33609 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pola1P33609 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Pola1P33609 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pola1P33609 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pola1P33609 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pola1P33609 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pola1P33609 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pola1P33609 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pola1P33609 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pola1P33609 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pola1P33609 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pola1P33609 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pola1P33609 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pola1P33609 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pola1P33609 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pola1P33609 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pola1P33609 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pola1P33609 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pola1P33609 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Pola1P33609 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Pola1P33609 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pola1P33609 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pola1P33609 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pola1P33609 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pola1P33609 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pola1P33609 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pola1P33609 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pola1P33609 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pola1P33609 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Pola1P33609 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Pola1P33609 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pola1P33609 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pola1P33609 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pola1P33609 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms