Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjc1P28229 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gjc1P28229 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjc1P28229 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjc1P28229 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjc1P28229 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjc1P28229 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjc1P28229 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjc1P28229 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjc1P28229 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjc1P28229 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjc1P28229 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjc1P28229 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjc1P28229 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjc1P28229 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjc1P28229 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjc1P28229 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjc1P28229 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjc1P28229 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjc1P28229 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjc1P28229 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjc1P28229 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjc1P28229 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gjc1P28229 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjc1P28229 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjc1P28229 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjc1P28229 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjc1P28229 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjc1P28229 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjc1P28229 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjc1P28229 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjc1P28229 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjc1P28229 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjc1P28229 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gjc1P28229 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gjc1P28229 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjc1P28229 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjc1P28229 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjc1P28229 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjc1P28229 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gjc1P28229 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gjc1P28229 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjc1P28229 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjc1P28229 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjc1P28229 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjc1P28229 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjc1P28229 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gjc1P28229 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gjc1P28229 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gjc1P28229 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjc1P28229 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjc1P28229 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjc1P28229 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjc1P28229 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjc1P28229 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjc1P28229 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjc1P28229 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gjc1P28229 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjc1P28229 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjc1P28229 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjc1P28229 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjc1P28229 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjc1P28229 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjc1P28229 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjc1P28229 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjc1P28229 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjc1P28229 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjc1P28229 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjc1P28229 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms