Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spta1P08032 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spta1P08032 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spta1P08032 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spta1P08032 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spta1P08032 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Spta1P08032 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spta1P08032 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spta1P08032 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spta1P08032 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spta1P08032 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spta1P08032 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spta1P08032 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spta1P08032 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spta1P08032 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spta1P08032 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spta1P08032 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spta1P08032 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Spta1P08032 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spta1P08032 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spta1P08032 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spta1P08032 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spta1P08032 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spta1P08032 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spta1P08032 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spta1P08032 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spta1P08032 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spta1P08032 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spta1P08032 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spta1P08032 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spta1P08032 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spta1P08032 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spta1P08032 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spta1P08032 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spta1P08032 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spta1P08032 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spta1P08032 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spta1P08032 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spta1P08032 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spta1P08032 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spta1P08032 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spta1P08032 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spta1P08032 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spta1P08032 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spta1P08032 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spta1P08032 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spta1P08032 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spta1P08032 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms