Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Lamc1P02468 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36,84■■■■□ 3,49
Lamc1P02468 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36,81■■■■□ 3,48
Lamc1P02468 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36,79■■■■□ 3,48
Lamc1P02468 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36,77■■■■□ 3,48
Lamc1P02468 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,77■■■■□ 3,48
Lamc1P02468 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36,76■■■■□ 3,47
Lamc1P02468 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,47
Lamc1P02468 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Lamc1P02468 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Lamc1P02468 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Lamc1P02468 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,72■■■■□ 3,47
Lamc1P02468 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,7■■■■□ 3,47
Lamc1P02468 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,66■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,65■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,64■■■■□ 3,46
Lamc1P02468 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Lamc1P02468 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Lamc1P02468 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36,62■■■■□ 3,45
Lamc1P02468 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Lamc1P02468 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Lamc1P02468 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Lamc1P02468 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Lamc1P02468 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Lamc1P02468 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Lamc1P02468 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Lamc1P02468 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Lamc1P02468 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Lamc1P02468 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Lamc1P02468 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Lamc1P02468 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Lamc1P02468 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36,49■■■■□ 3,43
Lamc1P02468 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Lamc1P02468 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Lamc1P02468 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Lamc1P02468 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36,48■■■■□ 3,43
Lamc1P02468 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Lamc1P02468 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36,46■■■■□ 3,43
Lamc1P02468 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Lamc1P02468 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Lamc1P02468 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Lamc1P02468 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Lamc1P02468 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Lamc1P02468 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,41■■■■□ 3,42
Lamc1P02468 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Lamc1P02468 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
Lamc1P02468 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Lamc1P02468 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36,38■■■■□ 3,41
Lamc1P02468 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Lamc1P02468 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Lamc1P02468 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Lamc1P02468 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Lamc1P02468 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Lamc1P02468 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36,28■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Lamc1P02468 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Lamc1P02468 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,25■■■■□ 3,39
Lamc1P02468 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Lamc1P02468 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36,21■■■■□ 3,39
Lamc1P02468 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Lamc1P02468 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Lamc1P02468 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Lamc1P02468 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Lamc1P02468 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36,18■■■■□ 3,38
Lamc1P02468 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Lamc1P02468 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Lamc1P02468 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36,16■■■■□ 3,38
Lamc1P02468 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,16■■■■□ 3,38
Lamc1P02468 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Lamc1P02468 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Lamc1P02468 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36,15■■■■□ 3,38
Lamc1P02468 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Lamc1P02468 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Lamc1P02468 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36,12■■■■□ 3,37
Lamc1P02468 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Lamc1P02468 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Lamc1P02468 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Lamc1P02468 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Lamc1P02468 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms