Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-K1P01901 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-K1P01901 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-K1P01901 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-K1P01901 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-K1P01901 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms