Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01800 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01800 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01800 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01800 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01800 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01800 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01800 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01800 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01800 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01800 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01800 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01800 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01800 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01800 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01800 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01800 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01800 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01800 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01800 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01800 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P01800 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01800 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01800 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01800 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01800 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01800 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01800 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01800 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01800 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01800 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01800 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01800 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01800 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
P01800 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01800 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01800 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01800 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01800 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01800 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01800 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01800 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01800 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01800 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P01800 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01800 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01800 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01800 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01800 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01800 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01800 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01800 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01800 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01800 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01800 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01800 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01800 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01800 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01800 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01800 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01800 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.3■■□□□ 1
P01800 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01800 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01800 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01800 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01800 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01800 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01800 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01800 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01800 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01800 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01800 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01800 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01800 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01800 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01800 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01800 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01800 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01800 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01800 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01800 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01800 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01800 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01800 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01800 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
P01800 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01800 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01800 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01800 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01800 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01800 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P01800 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01800 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01800 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01800 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01800 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01800 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01800 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01800 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01800 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms