Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01656 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01656 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
P01656 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
P01656 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01656 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01656 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01656 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01656 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01656 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01656 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01656 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01656 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01656 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P01656 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01656 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
P01656 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01656 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01656 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01656 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01656 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01656 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01656 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01656 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01656 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01656 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01656 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
P01656 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01656 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01656 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01656 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01656 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01656 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01656 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01656 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01656 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01656 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01656 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01656 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01656 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01656 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01656 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
P01656 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01656 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01656 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
P01656 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01656 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01656 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
P01656 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01656 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01656 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01656 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01656 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01656 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01656 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01656 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01656 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01656 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01656 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
P01656 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01656 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01656 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01656 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
P01656 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01656 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01656 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01656 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01656 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01656 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01656 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01656 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01656 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01656 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01656 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01656 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01656 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01656 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01656 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01656 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01656 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01656 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
P01656 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01656 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01656 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01656 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
P01656 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01656 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
P01656 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01656 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01656 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01656 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01656 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01656 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01656 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01656 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
P01656 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01656 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01656 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01656 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01656 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms