Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptch2O35595 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptch2O35595 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ptch2O35595 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ptch2O35595 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptch2O35595 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptch2O35595 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptch2O35595 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptch2O35595 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptch2O35595 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptch2O35595 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptch2O35595 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptch2O35595 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ptch2O35595 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ptch2O35595 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptch2O35595 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptch2O35595 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptch2O35595 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptch2O35595 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptch2O35595 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptch2O35595 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptch2O35595 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptch2O35595 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptch2O35595 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptch2O35595 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptch2O35595 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptch2O35595 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptch2O35595 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptch2O35595 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptch2O35595 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptch2O35595 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptch2O35595 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptch2O35595 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptch2O35595 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptch2O35595 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptch2O35595 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptch2O35595 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptch2O35595 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptch2O35595 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptch2O35595 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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