Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casq2O09161 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casq2O09161 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casq2O09161 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casq2O09161 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casq2O09161 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq2O09161 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq2O09161 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq2O09161 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casq2O09161 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casq2O09161 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casq2O09161 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casq2O09161 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casq2O09161 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casq2O09161 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casq2O09161 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Casq2O09161 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casq2O09161 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casq2O09161 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casq2O09161 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Casq2O09161 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Casq2O09161 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casq2O09161 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casq2O09161 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casq2O09161 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casq2O09161 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casq2O09161 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casq2O09161 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casq2O09161 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casq2O09161 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casq2O09161 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Casq2O09161 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casq2O09161 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casq2O09161 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casq2O09161 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casq2O09161 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casq2O09161 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casq2O09161 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casq2O09161 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Casq2O09161 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Casq2O09161 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casq2O09161 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casq2O09161 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casq2O09161 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casq2O09161 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casq2O09161 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casq2O09161 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casq2O09161 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casq2O09161 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms