Protein–RNA interactions for Protein: O08791

Ebf3, Transcription factor COE3, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf3O08791 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ebf3O08791 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ebf3O08791 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ebf3O08791 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ebf3O08791 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ebf3O08791 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ebf3O08791 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ebf3O08791 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ebf3O08791 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ebf3O08791 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ebf3O08791 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ebf3O08791 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ebf3O08791 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ebf3O08791 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ebf3O08791 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ebf3O08791 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ebf3O08791 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ebf3O08791 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ebf3O08791 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ebf3O08791 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ebf3O08791 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ebf3O08791 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ebf3O08791 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ebf3O08791 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ebf3O08791 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ebf3O08791 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ebf3O08791 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ebf3O08791 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ebf3O08791 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ebf3O08791 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ebf3O08791 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ebf3O08791 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ebf3O08791 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ebf3O08791 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ebf3O08791 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms