Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc149F6V035 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc149F6V035 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc149F6V035 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc149F6V035 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc149F6V035 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc149F6V035 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc149F6V035 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc149F6V035 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc149F6V035 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc149F6V035 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc149F6V035 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc149F6V035 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc149F6V035 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc149F6V035 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc149F6V035 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc149F6V035 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc149F6V035 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc149F6V035 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc149F6V035 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc149F6V035 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc149F6V035 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc149F6V035 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc149F6V035 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc149F6V035 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc149F6V035 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc149F6V035 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc149F6V035 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc149F6V035 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc149F6V035 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc149F6V035 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc149F6V035 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc149F6V035 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc149F6V035 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc149F6V035 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc149F6V035 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc149F6V035 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc149F6V035 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc149F6V035 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc149F6V035 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc149F6V035 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc149F6V035 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc149F6V035 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc149F6V035 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc149F6V035 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc149F6V035 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc149F6V035 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc149F6V035 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc149F6V035 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc149F6V035 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc149F6V035 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc149F6V035 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc149F6V035 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc149F6V035 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc149F6V035 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc149F6V035 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc149F6V035 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc149F6V035 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc149F6V035 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc149F6V035 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc149F6V035 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc149F6V035 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc149F6V035 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc149F6V035 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc149F6V035 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms