Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa27F2Z403 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa27F2Z403 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Defa27F2Z403 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms