Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ddx60E9PZQ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ddx60E9PZQ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ddx60E9PZQ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ddx60E9PZQ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ddx60E9PZQ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ddx60E9PZQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ddx60E9PZQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ddx60E9PZQ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ddx60E9PZQ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ddx60E9PZQ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ddx60E9PZQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ddx60E9PZQ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ddx60E9PZQ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ddx60E9PZQ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ddx60E9PZQ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ddx60E9PZQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ddx60E9PZQ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ddx60E9PZQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ddx60E9PZQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ddx60E9PZQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ddx60E9PZQ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ddx60E9PZQ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ddx60E9PZQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ddx60E9PZQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ddx60E9PZQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ddx60E9PZQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ddx60E9PZQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ddx60E9PZQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ddx60E9PZQ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ddx60E9PZQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ddx60E9PZQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ddx60E9PZQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Ddx60E9PZQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ddx60E9PZQ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ddx60E9PZQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ddx60E9PZQ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ddx60E9PZQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ddx60E9PZQ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ddx60E9PZQ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
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