Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dchs1E9PVD3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Dchs1E9PVD3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dchs1E9PVD3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dchs1E9PVD3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dchs1E9PVD3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dchs1E9PVD3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dchs1E9PVD3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dchs1E9PVD3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Dchs1E9PVD3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dchs1E9PVD3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dchs1E9PVD3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dchs1E9PVD3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dchs1E9PVD3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dchs1E9PVD3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dchs1E9PVD3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dchs1E9PVD3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dchs1E9PVD3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dchs1E9PVD3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dchs1E9PVD3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dchs1E9PVD3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dchs1E9PVD3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dchs1E9PVD3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dchs1E9PVD3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dchs1E9PVD3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dchs1E9PVD3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dchs1E9PVD3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dchs1E9PVD3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms