Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifit3bE9PV48 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifit3bE9PV48 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifit3bE9PV48 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifit3bE9PV48 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifit3bE9PV48 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifit3bE9PV48 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifit3bE9PV48 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifit3bE9PV48 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifit3bE9PV48 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifit3bE9PV48 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifit3bE9PV48 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifit3bE9PV48 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifit3bE9PV48 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifit3bE9PV48 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifit3bE9PV48 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifit3bE9PV48 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifit3bE9PV48 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifit3bE9PV48 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifit3bE9PV48 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit3bE9PV48 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms