Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NhsB1AV60 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NhsB1AV60 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NhsB1AV60 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NhsB1AV60 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
NhsB1AV60 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
NhsB1AV60 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NhsB1AV60 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NhsB1AV60 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NhsB1AV60 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NhsB1AV60 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NhsB1AV60 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NhsB1AV60 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NhsB1AV60 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NhsB1AV60 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NhsB1AV60 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NhsB1AV60 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
NhsB1AV60 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
NhsB1AV60 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NhsB1AV60 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
NhsB1AV60 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NhsB1AV60 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NhsB1AV60 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NhsB1AV60 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NhsB1AV60 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
NhsB1AV60 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NhsB1AV60 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NhsB1AV60 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NhsB1AV60 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NhsB1AV60 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NhsB1AV60 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NhsB1AV60 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NhsB1AV60 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NhsB1AV60 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NhsB1AV60 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NhsB1AV60 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NhsB1AV60 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NhsB1AV60 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NhsB1AV60 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NhsB1AV60 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NhsB1AV60 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NhsB1AV60 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NhsB1AV60 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NhsB1AV60 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NhsB1AV60 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NhsB1AV60 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NhsB1AV60 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NhsB1AV60 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NhsB1AV60 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NhsB1AV60 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NhsB1AV60 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NhsB1AV60 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NhsB1AV60 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NhsB1AV60 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NhsB1AV60 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NhsB1AV60 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NhsB1AV60 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NhsB1AV60 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NhsB1AV60 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NhsB1AV60 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NhsB1AV60 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NhsB1AV60 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NhsB1AV60 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NhsB1AV60 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NhsB1AV60 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NhsB1AV60 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NhsB1AV60 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NhsB1AV60 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NhsB1AV60 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NhsB1AV60 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NhsB1AV60 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
NhsB1AV60 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NhsB1AV60 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NhsB1AV60 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NhsB1AV60 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NhsB1AV60 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NhsB1AV60 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NhsB1AV60 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NhsB1AV60 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NhsB1AV60 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
NhsB1AV60 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NhsB1AV60 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NhsB1AV60 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
NhsB1AV60 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NhsB1AV60 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NhsB1AV60 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NhsB1AV60 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NhsB1AV60 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NhsB1AV60 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms