Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34c4A2ANA3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34c4A2ANA3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c4A2ANA3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn34c4A2ANA3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms