Protein–RNA interactions for Protein: A2AJA7

Mamdc4, Apical endosomal glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 1,228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mamdc4A2AJA7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mamdc4A2AJA7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mamdc4A2AJA7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mamdc4A2AJA7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mamdc4A2AJA7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mamdc4A2AJA7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mamdc4A2AJA7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mamdc4A2AJA7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mamdc4A2AJA7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mamdc4A2AJA7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mamdc4A2AJA7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mamdc4A2AJA7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mamdc4A2AJA7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mamdc4A2AJA7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mamdc4A2AJA7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mamdc4A2AJA7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Mamdc4A2AJA7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mamdc4A2AJA7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mamdc4A2AJA7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mamdc4A2AJA7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mamdc4A2AJA7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mamdc4A2AJA7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mamdc4A2AJA7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mamdc4A2AJA7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mamdc4A2AJA7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms