Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Frmpd4A2AFR3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Frmpd4A2AFR3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd4A2AFR3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Frmpd4A2AFR3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Frmpd4A2AFR3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Frmpd4A2AFR3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd4A2AFR3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd4A2AFR3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd4A2AFR3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd4A2AFR3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd4A2AFR3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmpd4A2AFR3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd4A2AFR3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd4A2AFR3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd4A2AFR3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd4A2AFR3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd4A2AFR3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd4A2AFR3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd4A2AFR3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Frmpd4A2AFR3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frmpd4A2AFR3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd4A2AFR3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd4A2AFR3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd4A2AFR3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd4A2AFR3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd4A2AFR3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd4A2AFR3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd4A2AFR3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd4A2AFR3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd4A2AFR3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd4A2AFR3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd4A2AFR3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd4A2AFR3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Frmpd4A2AFR3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd4A2AFR3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Frmpd4A2AFR3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Frmpd4A2AFR3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Frmpd4A2AFR3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Frmpd4A2AFR3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Frmpd4A2AFR3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Frmpd4A2AFR3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Frmpd4A2AFR3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Frmpd4A2AFR3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Frmpd4A2AFR3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Frmpd4A2AFR3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Frmpd4A2AFR3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Frmpd4A2AFR3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmpd4A2AFR3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd4A2AFR3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Frmpd4A2AFR3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd4A2AFR3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd4A2AFR3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Frmpd4A2AFR3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd4A2AFR3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmpd4A2AFR3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmpd4A2AFR3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmpd4A2AFR3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Frmpd4A2AFR3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Frmpd4A2AFR3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd4A2AFR3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd4A2AFR3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Frmpd4A2AFR3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmpd4A2AFR3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd4A2AFR3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd4A2AFR3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmpd4A2AFR3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Frmpd4A2AFR3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd4A2AFR3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmpd4A2AFR3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms