Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm884A2A9H6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm884A2A9H6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm884A2A9H6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm884A2A9H6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm884A2A9H6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm884A2A9H6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm884A2A9H6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm884A2A9H6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm884A2A9H6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm884A2A9H6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm884A2A9H6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm884A2A9H6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm884A2A9H6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm884A2A9H6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm884A2A9H6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm884A2A9H6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm884A2A9H6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm884A2A9H6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm884A2A9H6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm884A2A9H6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm884A2A9H6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm884A2A9H6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm884A2A9H6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm884A2A9H6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm884A2A9H6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm884A2A9H6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm884A2A9H6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm884A2A9H6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm884A2A9H6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm884A2A9H6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm884A2A9H6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm884A2A9H6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm884A2A9H6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm884A2A9H6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm884A2A9H6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm884A2A9H6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm884A2A9H6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm884A2A9H6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms