Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shisal2aA2A9G7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shisal2aA2A9G7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Shisal2aA2A9G7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shisal2aA2A9G7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisal2aA2A9G7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisal2aA2A9G7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms