Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms