Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms