Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PADI3Q9ULW8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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