Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGA2Q9UJY4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA2Q9UJY4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms