Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms