Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2IRD1Q9UHL9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms