Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP36Q9P275 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms