Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPCPD1Q9NPB8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms